铁路总价承包合同中清单负量差的处理办法？

浙C交通

各位同仁，我是在铁路项目上从事计划合同经营工作，我们这个工程是采用初步设计招标中标的总价承包合同，初步设计招标不可避免会与实际施工图纸存在量差问题，正量差（施工量大于清单量）由风险费包干，那么负量差在总价承包合同中该如何处理呢？现在的情况是蓝图已经出来了，而且已经按照图纸干了一年了，如何按照实际施工量对上计价的话，那部分钱施工方拿不回来，也不能压在业主那里，如果等审计的时候核减掉这部分投资是不是会对业主与设计院都不利？所以，咱们施工方即使是“受再大的委屈”也得把这份钱背回家啊~~咱这又是总承包的，也说的过去，但合理还得合法，审计清概咱不能出问题，所以请教下各位前辈，该如何有什么办法处理这个负量差的问题呢？联系设计院更换图纸加大设计量？但蓝图已经出了而且已经干了个7788了。还是多做变更来充抵？二类变更是风险费包干的又没用，只能做一类的，但一类可是要上报铁道部批准的，该如何是好？